Po doktoratu na temo povezave med reliefom in gibanjem prebivalstva v Sloveniji se je Drago Perko zaposlil na Geografskem inštitutu Antona Melika ZRC SAZU. Tam je med drugim vodil raziskovalni program Regionalna geografija Slovenije in različne raziskovalne projekte, v katerih je preučeval kulturne pokrajine, geografsko mikroregionalizacijo, skupna zemljišča v Sloveniji, mehanizme regionalne politike, naravne pokrajinske tipe ter pokrajinsko raznolikost in vroče točke Slovenije.
Kot avtor številnih znanstvenih člankov se je ukvarjal predvsem z regionalno geografijo, geografskimi informacijskimi sistemi, digitalno tematsko kartografijo in zemljepisnimi imeni. Sodeloval je pri pripravi temeljnih geografskih knjižnih in kartografskih monografij o Sloveniji: Regionalnogeografska monografija Slovenije, Krajevni leksikon Slovenije, Geografski atlas Slovenije, prvi nacionalni atlas, in digitalni zemljevid Relief Slovenije.
Drago Perko je bil izjemno aktiven kot urednik znanstvenih revij in knjižnih zbirk, med drugim je član uredniškega odbora Acta geographica Slovenica. Že tri desetletja, vse od leta 1995, pa deluje kot član Komisije za standardizacijo zemljepisnih imen Vlade Republike Slovenije.
Zaradi večdesetletnega odličnega raziskovalnega dela, četrtstoletnega vodenja Geografskega inštituta Antona Melika ter predanega in zavzetega udejstvovanja za dobrobit geografije, humanistike in ZRC SAZU, prejme naziv zaslužni raziskovalec ZRC SAZU.
